שעון גאלאקסי יוכל לחזות התעלפויות, קרדיט: סאמסונג
שעון גאלאקסי יוכל לחזות התעלפויות, קרדיט: סאמסונג

המספר שמבטיח לומר לך בן כמה אתה באמת: מה בעצם מודדים השעונים האפיגנטיים

אלגוריתם שקורא סימנים כימיים על גבי ה-DNA ומחזיר גיל ביולוגי הפך לבסיס של תעשיית בדיקות שלמה. המחקר שמאחוריו מתפרסם בכתבי עת מובילים, אבל אותה דגימת דם שנמדדת פעמיים יכולה להחזיר פער של תשע שנים, וניסוי מבוקר גדול הראה שהתערבות אחת מזיזה שעון אחד ומשאירה אחרים במקומם

מירב ארד |

ערכה שנשלחת בדואר, דגימת דם או רוק, וכעבור כמה שבועות מספר בדוח: הגיל הביולוגי שלך הוא 47.3. סביב המשפט הזה נבנה בשנים האחרונות שוק שלם, והוא נשען על משפחה של אלגוריתמים שנקראים שעונים אפיגנטיים ומעריכים גיל לפי דפוסי מתילציה על גבי ה-DNA. המחקר שמאחוריהם אמיתי לגמרי ומתפרסם בכתבי עת מהשורה הראשונה. השאלה ששרדה את כל העשור הזה היא מה בדיוק המספר מודד.

קבוצת מתיל אחת על אות אחת בגנום

הסימן הכימי שעליו מדובר פשוט להפליא. קבוצת מתיל, אטום פחמן עם שלושה מימנים, נקשרת לבסיס ציטוזין שיושב לפני גואנין ברצף ה-DNA. הצמד הזה נקרא אתר CpG, ובגנום האנושי יש עשרות מיליונים כאלה. רמת המתילציה באתר מסוים משפיעה על מידת הביטוי של הגן שלידו, והיא משתנה לאורך החיים בתגובה לגיל, לחשיפות סביבתיות ולמצב הרקמה. הרצף עצמו נשאר קבוע, מה שמשתנה הוא הסימון שמעליו. אלגוריתם שקורא כמה מאות אתרים כאלה ומשקלל אותם יכול להחזיר מספר שמתאם היטב עם הגיל, וזה מה שהודגם לראשונה ב-2013.

שתי עבודות יצאו אז כמעט במקביל. סטיב הורבת מבית הספר לרפואה ע"ש דיוויד גפן ב-UCLA פרסם ב-Genome Biology מודל שמעריך גיל כרונולוגי מתוך רמות המתילציה ב-353 אתרי CpG בגנום. הייחוד שלו היה ביכולת לעבוד על מגוון רחב של רקמות עם אותה נוסחה עצמה - דם, מוח קטן, מעי גס, כליה, כבד וריאה - ולאורך טווח גילים שנמתח מהעובר ועד הזקנה. באותה שנה פרסם גרגורי הנום ועמיתיו ב-Molecular Cell שעון שאומן על דם בלבד, עם 71 אתרים, שהתברר כמדויק יותר בדגימות דם של מבוגרים.

מאחורי כל שעון עומדת גם פיסת חומרה. רוב העבודות בתחום מודדות מתילציה בעזרת שבבי מיקרו-מערך מסחריים, שסורקים מאות אלפי אתרי CpG נבחרים מתוך עשרות המיליונים שקיימים בגנום. הדורות של השבבים האלה התחלפו לאורך העשור, וכל דור החליף חלק מהאתרים הנמדדים. לכך יש תוצאה מעשית מאוד: שעון שאומן על דור אחד של שבב עלול למצוא שכמה מהאתרים שהוא נשען עליהם חסרים בדור הבא, והתוכנה משלימה אותם בהערכה סטטיסטית. זה מקור נוסף להפרשים בין מדידות, והוא יושב הרחק מתחת לדוח שמגיע לצרכן.

המעניין התחיל כשהפער בין הגיל שהמודל חוזה לבין הגיל בתעודת הזהות התברר כבעל משמעות בריאותית. בעבודה שפורסמה ב-Aging ב-2016, קונסורציום של עשרות מוסדות בהובלת הורבת ניתח נתונים של יותר מ-13 אלף אנשים מארצות הברית ומאירופה, ובהם משתתפי מחקר הלב של פרמינגהם. "גילינו שחמישה אחוזים מהאוכלוסייה מזדקנים בקצב ביולוגי מהיר יותר, מה שמביא לתוחלת חיים קצרה יותר", אמר הורבת בהודעה לעיתונות של UCLA, והוסיף כי "הזדקנות מואצת מעלה את סיכון התמותה של המבוגרים האלה בחמישים אחוז בכל גיל". בריאן צ'ן, שהיה אז בתר-דוקטורנט במכון הלאומי האמריקאי להזדקנות, מסר שהשעון ניבא תוחלת חיים בכמה קבוצות אוכלוסייה גם אחרי תקנון לגורמי הסיכון המוכרים.

הדור השני: אימון על תוצאות במקום על שנים

ההבנה שהגיל הכרונולוגי הוא יעד אימון חלש הובילה לגישה אחרת. מורגן לוין, אז מאוניברסיטת ייל, בנתה ב-2018 שעון בשם PhenoAge. במקום לאמן את המודל לחזות שנים, היא הגדירה תחילה גיל פנוטיפי לפי תשעה מדדים קליניים ולפי הגיל הכרונולוגי, ואז חיפשה את אתרי המתילציה שמנבאים אותו. התוצאה כללה 513 אתרים והצליחה טוב יותר בניבוי תמותה, סרטן ותפקוד גופני. שנה אחר כך הוסיפו איילי לו והורבת את GrimAge, שנבנה בהיגיון דומה: תחילה נבנו אומדני מתילציה לשבעה חלבוני פלזמה, בהם ציסטטין C ולפטין, וגם למספר שנות העישון המדווחות, ואז שולבו כולם למדד יחיד. GrimAge ניבא תמותה ומחלות גיל טוב יותר מקודמיו.

ההיגיון שמאחורי המהלך הזה שווה הסבר. מודל שמאומן לחזות גיל כרונולוגי מוענש בדיוק על הטעויות שמעניינות את הרפואה: אדם בן 60 שנראה ביולוגית כמו בן 72 נספר כשגיאה של המודל, ולכן תהליך האימון דוחף להיפטר מהאותות שמייצרים אותה. אימון על תמותה או על מדדים קליניים הופך את אותה שגיאה לאות המרכזי שהמודל מחפש.

הענף השלישי שונה במהותו. דניאל בלסקי מאוניברסיטת קולומביה בנה מדד שמנסה למדוד קצב הזדקנות במקום מרחק שנצבר. הבסיס הוא מחקר דנידין בניו זילנד, שעוקב אחרי כאלף אנשים שנולדו בשנים 1972 ו-1973 ומודד אצלם 19 מדדי תפקוד של מערכות הגוף בארבעה מועדי מדידה לאורך שני עשורים. מתוך שיפוע השינוי האישי בכל מדד נגזר קצב הזדקנות אישי, וממנו אומן אלגוריתם מתילציה בשם DunedinPACE, שמנסה להחזיר את הקצב מדגימה בודדת. ההבדל בין ההיגיון הזה לבין שעון שמעריך גיל דומה להבדל בין מד מהירות למד קילומטראז'.

אותה דגימה, תשע שנים הפרש

ב-2022 פרסמו אלברט היגינס-צ'ן ומורגן לוין מאוניברסיטת ייל עבודה ב-Nature Aging שהצביעה על בעיה יסודית: אותה דגימת דם עצמה, כשנמדדת פעמיים, מחזירה תוצאות שונות. "מצאנו שעונים אפיגנטיים שיכולים לומר שאתה בן 50 מבחינה ביולוגית בבדיקה אחת, ואז 59 בבדיקה הבאה", אמר היגינס-צ'ן. הפערים שנמדדו בשישה שעונים מרכזיים נעו בין שלוש לתשע שנים, ומקורם ברעש מדידה: הבדלי ציוד, אצוות ריאגנטים שונות, צוותי מעבדה ותנאי סביבה. לדבריו, תשומת לב מועטה יחסית הוקדשה עד אז לאמינות המדידה החוזרת של שעונים אפיגנטיים.

גודל הפער הזה הוא שמכריע את הערך המעשי של הבדיקה. אם הטעות במדידה עומדת על שלוש עד תשע שנים, וההשפעה שהתערבות באורח חיים מסוגלת לייצר נמדדת בחודשים או בשנה, הרעש בולע את האות. במונחים מעשיים: אדם שנבדק, שינה משהו בהתנהגותו ונבדק שוב, יקבל מספר אחר גם אם הכול נשאר בדיוק כשהיה.

הפתרון שהציעו היה חישובי. במקום להאכיל את המודל באתרי CpG בודדים, הם חילצו רכיבים ראשיים מהנתונים, שמכילים את השונות המשותפת ומדכאים את הרעש האקראי של אתר יחיד. בגרסאות המחודשות רוב המדידות הכפולות התכנסו לפער שקטן משנה. לוין, שעברה מאז למעבדות אלטוס, סייגה שהשעונים מבטיחים הרבה כסמנים ביולוגיים של הזדקנות, ושנדרשת עבודה מתמשכת כדי להפוך אותם לאמינים ותקפים דיים לשימוש בבחינת התערבויות בהזדקנות ובמחלה.

יש הסתייגות נוספת, עקרונית יותר. רוב השעונים נמדדים בדם מלא, שהוא תערובת של סוגי תאים: לימפוציטים, מונוציטים, גרנולוציטים. ההרכב הזה משתנה עם הגיל, עם מחלה ועם דלקת, ולכל סוג תא חתימת מתילציה משלו. מכאן עולה השאלה כמה מהאות שהשעון קורא משקף הזדקנות של התאים עצמם, וכמה ממנו משקף שינוי בהרכב התאים בדגימה. חלק מהמודלים כוללים תיקון סטטיסטי להרכב התאים, וההשוואה בין גרסה מתוקנת לגרסה הגולמית מניבה לפעמים מסקנות שונות. גם המתאם בין שעונים שונים חלקי בלבד, ובסקירה ביקורתית שפורסמה ב-Frontiers in Aging ב-2024 צוין ש-DunedinPACE מתואם באופן חלש עם שעונים שאומנו לחזות גיל, מפני שהוא נבנה מלכתחילה למדוד דבר אחר.

שווה גם לדעת איפה השעונים מראים אותות חזקים במיוחד. כבר בעבודה של 2013 נמצא שרקמת גידול סרטני מחזירה גיל אפיגנטי גבוה בהרבה מזה של האדם שממנו נלקחה, לעיתים בעשרות שנים. הממצא עורר עניין רב, והוא ממחיש היטב למה מספר יחיד קשה לפירוש: אותו אלגוריתם עצמו מגיב לקצב חלוקת תאים, לדלקת ולשינוי בהרכב הרקמה, וכל אלה מתערבבים לתוך אות אחד. מכאן גם המרחק בין כלי מחקר לבין אמצעי אבחון, והסיבה שרשויות הבריאות ממשיכות לסווג את הבדיקות האלה בקטגוריית הרווחה.

ועדיין, סביב המדדים האלה קמה תעשייה. ערכות לצרכן נמכרות ברשת בטווח של מאות דולרים, ומגיעות עם דוח שמציג גיל ביולוגי, קצב הזדקנות ולעיתים גם המלצות אורח חיים. הרגולציה מאחור רופפת: בדיקות ישירות לצרכן שמשווקות למטרות רווחה או בריאות כללית יושבות מחוץ למסלול האישור המוקדם של ה-FDA, ואף שעון אפיגנטי טרם עבר אישור כאמצעי אבחון. התוצאה המעשית היא שאותו אדם שנבדק אצל שני ספקים עשוי לקבל שני מספרים רחוקים זה מזה, וגם בדיקה חוזרת אצל אותו ספק עשויה לזוז. מי ששוקל רכישה כזאת יעשה נכון אם יברר תחילה באיזה שעון בדיוק נעשה שימוש, אם הגרסה כוללת תיקון רכיבים ראשיים, ואיזה נתון על שחזור המדידה הספק מוכן להציג.

קיראו עוד ב"מדע"

מעבר לדוח האישי, למספר הזה יש שימושים פוטנציאליים שנוגעים ישירות בכיס. חברות ביטוח חיים מתמחרות סיכון לפי גיל ולפי מצב בריאותי, ומדד שמנבא תמותה טוב יותר מהגיל שבתעודת הזהות הוא בדיוק סוג הכלי שמעניין חתם. גם קרנות פנסיה ותוכניות בריאות תאגידיות מביטות לכיוון. כל עוד שחזור המדידה נותר בעייתי, השימושים האלה נשארים בגדר אפשרות תיאורטית, וזו אחת הסיבות שהוויכוח על אמינות השעונים חורג הרבה מעבר לשאלה מדעית.

מה קרה כשניסו להזיז את המחוג

הניסוי המבוקר הרציני ביותר בתחום הוא CALERIE, שבו 220 מבוגרים בריאים חולקו אקראית לקבוצת הגבלה קלורית ביעד של 25 אחוז ולקבוצת ביקורת, למשך שנתיים. בניתוח שפורסם ב-Nature Aging ב-2023, בהובלת רנא וזירי ובלסקי, נמצאה האטה של שניים עד שלושה אחוזים בקצב ההזדקנות לפי DunedinPACE. לפי אותה עבודה, סדר גודל כזה מקביל לירידה של עשרה עד חמישה עשר אחוזים בסיכון התמותה, בדומה להשפעה של גמילה מעישון. אלא שאותה התערבות עצמה השאירה את PhenoAge ואת GrimAge כמעט במקומם.

קיילן ראיין, מדען חוקר במרכז באטלר להזדקנות בקולומביה, הסביר שההבדל בתוצאות מרמז שמדדים דינמיים של קצב הזדקנות רגישים יותר להשפעת התערבות מאשר מדדים סטטיים של גיל ביולוגי. בלסקי הציב את המסגרת הרחבה יותר: לדבריו, בתולעים, בזבובים ובעכברים הגבלה קלורית מאטה תהליכי הזדקנות ומאריכה חיים בריאים, והמחקר נועד לבדוק אם הדבר תקף גם באדם. באותה אמירה מופיעה גם הסיבה שבגללה נדרש שעון מלכתחילה: בני אדם חיים שנים רבות, ומעקב עד להופעת מחלות גיל או תמותה אורך זמן רב מדי כדי לשמש כלי מחקר מעשי.

שווה לעצור על גודל האפקט. שנתיים של הגבלה קלורית מתמשכת, מסגרת מחקרית עם ליווי צמוד, והתוצאה היא שניים עד שלושה אחוזים בקצב. זו התערבות מהתובעניות ביותר שנבדקו אי פעם בבני אדם, והתזוזה שהיא הפיקה עדינה. כל מוצר שמבטיח קפיצה גדולה בהרבה בזמן קצר בהרבה נמדד מול הרף הזה.

מחקרי התערבות קצרים מציגים דווקא מספרים גדולים יותר, וגם מדגמים קטנים בהרבה. תוכנית תזונה ואורח חיים בת שמונה שבועות דיווחה על הפרש של כ-3.2 שנים בשעון של הורבת, נתון שנשען על עשרות משתתפים ועל פרק זמן שקצר מכדי שהזדקנות ביולוגית תשתנה בו במידה כזו. הפער בין גודל האפקט המדווח לבין משך ההתערבות הוא בדיוק מה שמזין את הספק בקרב חוקרי התחום.

מה שיכריע כאן הוא ככל הנראה שילוב של שניים: תקינה מעבדתית שתאפשר להשוות מדידה של אותו אדם בין ספקים ובין מועדים, ומחקרי אורך שיבדקו אם מי ששעונו הואט אכן חולה פחות ומאריך ימים בפועל. במקביל כבר נבנה במעבדות דור נוסף של מדדים, כאלה שמאומנים ישירות על תוצאות בריאותיות ומתוקננים בין מעבדות מראש. מה שיעמוד למבחן שם הוא אם התערבות באורח חיים מזיזה את ההזדקנות עצמה, או את הקריאה של המכשיר.

הוספת תגובה

תגובות לכתבה:

הגב לכתבה

השדות המסומנים ב-* הם שדות חובה