אגף המכס הוא הזרוע של רשות המסים האחראית על גביית מסי ייבוא ועל הפיקוח על סחורות שנכנסות ויוצאות מישראל. הוא גובה מכס, מע"מ
על ייבוא ומס קנייה, קובע סיווג של טובין לפי צו התעריף, ומפעיל אכיפה נגד הברחות, הצהרות כוזבות וחשבוניות פיקטיביות. להחלטות שלו יש השפעה ישירה על מחירי מוצרים בישראל, שכן שינוי בסיווג או ביטול מכס על קטגוריה שלמה יכולים להוזיל מוצרי צריכה. סוגיה צרכנית מרכזית
היא תקרת הפטור על ייבוא אישי מאתרי מסחר אלקטרוני, שמעצבת את התחרות מול הקמעונאות המקומית. האגף מעורב גם בחקירות פליליות בתחום היבוא ובשיתופי
פעולה עם רשויות מקבילות בעולם.
תושב ירושלים שנקנס בעשרות אלפי שקלים לאחר שנתפס עם שעוני יוקרה בנתב"ג, שילם את הקנס המנהלי במלואו אך המשיך לקבל מכתבי דרישת תשלום - שלוש פעמים ברציפות, ואף שהוא יצר קשר כל פעם כדי לוודא שאין חוב. לדבריו, הדבר גרם לו לחשש תמידי מהרשויות ולעוגמת נפש משמעותית.
בית המשפט לתביעות קטנות קבע כי יש לפצותו בסכום כולל של 900 שקל בגין הנזק הלא-ממוני שנגרם לו, והוסיף הוצאות משפט בסכום של 1,000 שקל