שלומי הייזלר כיהן כמנהל הכללי של משרד האוצר, התפקיד הבכיר ביותר בסגל המקצועי של המשרד. המנהל הכללי אחראי על תיאום בין אגפי המשרד, בהם אגף התקציבים, החשב הכללי ורשות המסים, ועל קידום מהלכי מדיניות
מול משרדי ממשלה אחרים ומול הרגולטורים הפיננסיים. תקופת כהונה במשרה כזו מתאפיינת בעימותים מובנים בין הצורך לשמור על מסגרת תקציב המדינה לבין דרישות מגזריות להגדלת הוצאה. בין הסוגיות שנדונו בתקופתו נמנו
רפורמות בשוק הביטוח, ובהן הצעות להפרדה בין סוגי מוצרים, שעוררו התנגדות מצד חברות הביטוח. פרישה מתפקיד כזה נחשבת לאירוע בעל השפעה על קצב קידום רפורמות במשק.